Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Ralgapa1-212ENSMUST00000226244 8841 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Klf6-201ENSMUST00000000080 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Bicc1-202ENSMUST00000131445 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 0610037L13Rik-204ENSMUST00000106727 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm14099-201ENSMUST00000117769 605 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm11621-201ENSMUST00000118253 589 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm15941-204ENSMUST00000135401 726 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm26048-201ENSMUST00000157305 142 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm45889-201ENSMUST00000209535 1057 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm19810-201ENSMUST00000218521 251 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 AC131745.3-201ENSMUST00000223582 554 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 AC165281.1-201ENSMUST00000225713 1011 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 A230001M10Rik-202ENSMUST00000196720 1307 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Prb1-201ENSMUST00000087853 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Trpm6-201ENSMUST00000040489 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm5721-201ENSMUST00000119845 1696 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Anapc15-210ENSMUST00000144207 3103 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Prss35-201ENSMUST00000036426 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 AC112265.1-201ENSMUST00000213522 1501 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm5915-201ENSMUST00000116136 454 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm11348-201ENSMUST00000118813 318 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm2214-201ENSMUST00000121333 330 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm14830-201ENSMUST00000121899 700 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms