Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm15753-201ENSMUST00000119241 1062 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm11800-201ENSMUST00000120050 579 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Trim35Q8C006 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Trim35Q8C006 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 A130023I24Rik-201ENSMUST00000152709 1897 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Olfr467-202ENSMUST00000208563 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Arpp19-205ENSMUST00000168166 3944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Trim35Q8C006 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Abhd4-202ENSMUST00000180359 2508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Trim9-211ENSMUST00000223160 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 AC160413.2-201ENSMUST00000217790 2280 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Trim35Q8C006 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Trim35Q8C006 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Trim35Q8C006 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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Trim35Q8C006 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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