Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Epas1-201ENSMUST00000024954 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Clcn7-201ENSMUST00000040729 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 AC093043.2-201ENSMUST00000228616 2017 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gfpt2-201ENSMUST00000020629 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Slc16a7-201ENSMUST00000063318 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Fmr1os-201ENSMUST00000181533 2743 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm15709-201ENSMUST00000118354 213 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 AC162934.2-201ENSMUST00000221451 249 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Def8-204ENSMUST00000108830 3191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprkP35822 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprkP35822 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprkP35822 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Tnr-201ENSMUST00000111669 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Pde6a-201ENSMUST00000025468 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Lgals8-207ENSMUST00000143693 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Adgrg1-201ENSMUST00000093271 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Adam17-201ENSMUST00000064536 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Scrn3-201ENSMUST00000090811 3309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gpbp1-202ENSMUST00000091236 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm43917-201ENSMUST00000191984 2360 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Il1rap-203ENSMUST00000166294 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Cd101-202ENSMUST00000167086 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Diexf-201ENSMUST00000085555 5570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Pex5l-208ENSMUST00000192093 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprkP35822 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Psmb11-201ENSMUST00000097177 4247 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Itgam-205ENSMUST00000120355 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Ap3b2-201ENSMUST00000082090 3804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Tmem175-202ENSMUST00000078323 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PtprkP35822 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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