Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ighv1-82-201ENSMUST00000103549 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gm23358-201ENSMUST00000103887 110 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Amd-ps4-201ENSMUST00000118392 1003 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Vmn1r-ps103-201ENSMUST00000120171 893 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gm12594-201ENSMUST00000132140 499 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Defa-ps3-201ENSMUST00000142705 282 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 A530010F05Rik-201ENSMUST00000146845 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Arhgef38-204ENSMUST00000161932 1033 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Sfta2-202ENSMUST00000174521 649 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Trav5d-4-201ENSMUST00000179701 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Trav5n-4-201ENSMUST00000179997 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gm29577-201ENSMUST00000186427 693 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 1700008B11Rik-201ENSMUST00000198145 634 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gm43069-201ENSMUST00000201006 859 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gm3774-201ENSMUST00000209773 435 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 AC158239.1-201ENSMUST00000216890 779 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gpx4-ps2-202ENSMUST00000217344 782 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gm19810-201ENSMUST00000218521 251 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 AC132304.1-201ENSMUST00000218860 135 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gm46313-201ENSMUST00000220463 547 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Olfr1255-201ENSMUST00000057369 933 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gm12378-201ENSMUST00000116171 1461 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Olfr221-204ENSMUST00000216188 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gm20745-201ENSMUST00000216827 3796 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Gm17821-201ENSMUST00000223448 1693 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Ipcef1-201ENSMUST00000078070 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 Zcwpw2-201ENSMUST00000111769 1505 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
P20040 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm4673-201ENSMUST00000181395 3660 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm13674-201ENSMUST00000121276 823 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm15941-204ENSMUST00000135401 726 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm14339-201ENSMUST00000146224 423 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Ighv1-62-2-201ENSMUST00000163467 302 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Ighv1-71-201ENSMUST00000166645 302 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm3002-202ENSMUST00000178256 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm2974-202ENSMUST00000180184 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Tnfaip8-213ENSMUST00000180305 369 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm32569-201ENSMUST00000193955 604 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm40040-201ENSMUST00000196123 504 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm43805-201ENSMUST00000198488 824 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Abracl-201ENSMUST00000020002 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm16273-201ENSMUST00000202238 268 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 RMST_1.1-214ENSMUST00000220389 633 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 AV026068-225ENSMUST00000225042 490 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm5619-201ENSMUST00000071172 760 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
P20040 Olfr608-201ENSMUST00000213546 1482 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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