Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Vipas39-201ENSMUST00000021426 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 D7Bwg0826e-201ENSMUST00000208484 3795 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Scn3b-201ENSMUST00000049941 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm37150-201ENSMUST00000193900 2754 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Cyp17a1-201ENSMUST00000026012 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Sycp1-201ENSMUST00000029448 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Hspbap1-201ENSMUST00000023555 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Mcm7-201ENSMUST00000000505 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Arhgap21-213ENSMUST00000173194 6920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Lrrc18-203ENSMUST00000120866 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Pygl-202ENSMUST00000161083 2992 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 AC162176.1-201ENSMUST00000216490 618 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Rpl21-ps5-201ENSMUST00000095940 483 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Olfr650-ps1-201ENSMUST00000121432 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 L3mbtl3-201ENSMUST00000040219 4572 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Vrk1-203ENSMUST00000085026 3711 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 EU599041-203ENSMUST00000205748 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 1500004A13Rik-202ENSMUST00000183707 6054 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm26785-201ENSMUST00000181775 2914 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 AC164437.4-204ENSMUST00000227169 4024 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Syt11-201ENSMUST00000090945 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Rfxank-201ENSMUST00000075724 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Dhx30-202ENSMUST00000111991 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Tvp23a-201ENSMUST00000051118 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Nutm1-201ENSMUST00000043970 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Luzp4-202ENSMUST00000163338 2025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Nufip1-201ENSMUST00000022586 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Acly-207ENSMUST00000165111 4162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Uqcrq-202ENSMUST00000109019 504 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm29018-202ENSMUST00000191356 313 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm42760-201ENSMUST00000199814 311 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 AC124397.1-201ENSMUST00000224296 653 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Scn3b-202ENSMUST00000114956 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Prps1l1-201ENSMUST00000134550 1676 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Tacc2-202ENSMUST00000059145 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Atg3Q9CPX6 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms