Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Olfr1155-201ENSMUST00000099843 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Stk26-201ENSMUST00000033444 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Usp4-209ENSMUST00000194959 3436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm38066-201ENSMUST00000193223 1634 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Nkiras1-202ENSMUST00000132374 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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Trim35Q8C006 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 CT009757.1-201ENSMUST00000222801 738 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 A730032A03Rik-202ENSMUST00000143202 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Cldn12-207ENSMUST00000179804 3752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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