Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm12126-201ENSMUST00000147717 619 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Synj2-201ENSMUST00000061091 4072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Cpsf6-208ENSMUST00000177145 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Bdp1-204ENSMUST00000109379 7567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 AC138284.3-201ENSMUST00000217345 4663 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Ebf2-201ENSMUST00000022637 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Tnfsf15-201ENSMUST00000062246 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Wdr48-201ENSMUST00000036561 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Mpdz-201ENSMUST00000102830 7512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Cdh16-201ENSMUST00000163783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Sec24c-201ENSMUST00000048657 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Clip4-201ENSMUST00000024854 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Prpf40a-208ENSMUST00000210789 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Nod2-202ENSMUST00000109634 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Spag9-205ENSMUST00000103168 6840 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm28352-201ENSMUST00000186654 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm29654-201ENSMUST00000186886 2169 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm28226-201ENSMUST00000186916 2169 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm28972-201ENSMUST00000186990 2167 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm29302-201ENSMUST00000187209 2167 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm28866-201ENSMUST00000187298 2167 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm28878-201ENSMUST00000188272 2167 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm28246-201ENSMUST00000188308 2167 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm28823-201ENSMUST00000188540 2167 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm29046-201ENSMUST00000188653 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm28346-201ENSMUST00000189021 2167 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 4933427D14Rik-202ENSMUST00000108506 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Map4k4-209ENSMUST00000192509 3918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Tacc2-202ENSMUST00000059145 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms