Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm27197-201ENSMUST00000184325 479 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Scgb1b9-ps-201ENSMUST00000191567 266 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm16273-201ENSMUST00000202238 268 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm45155-201ENSMUST00000207365 596 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm4800-201ENSMUST00000215776 1266 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gnpnat1-202ENSMUST00000226276 710 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Plac8-201ENSMUST00000031264 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Thyn1-201ENSMUST00000039161 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm8623-201ENSMUST00000071573 436 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Olfr1283-201ENSMUST00000090328 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 6330409D20Rik-201ENSMUST00000009695 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Hist1h4f-201ENSMUST00000102971 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Hist1h4h-201ENSMUST00000102972 470 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Ighj1-201ENSMUST00000103430 53 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm12883-201ENSMUST00000117867 364 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm15520-201ENSMUST00000132097 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Rsrc1-209ENSMUST00000162693 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm28281-201ENSMUST00000185658 187 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm3142-201ENSMUST00000190107 414 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Mir7230-201ENSMUST00000195977 56 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm18339-201ENSMUST00000218074 888 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 AC124712.1-201ENSMUST00000221833 445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Olfr518-201ENSMUST00000059617 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Cst7-201ENSMUST00000089200 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 A630095E13Rik-201ENSMUST00000093868 619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Oat-201ENSMUST00000084500 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Rnase13-201ENSMUST00000089771 1412 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm24938-201ENSMUST00000102225 110 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Gm13407-201ENSMUST00000118256 360 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
H2-Eb1P04230 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms