Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Patj-202ENSMUST00000041284 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Dlgap5-201ENSMUST00000043296 2964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Grb10-203ENSMUST00000109654 4755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm29128-201ENSMUST00000186448 2858 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Ep400-203ENSMUST00000112435 10420 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Bdnf-202ENSMUST00000111042 3905 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm43080-201ENSMUST00000199006 2643 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Luzp4-202ENSMUST00000163338 2025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Prps1l1-201ENSMUST00000134550 1676 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Nedd4l-204ENSMUST00000224347 3150 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Slc39a9-201ENSMUST00000085245 5201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Katnal1-201ENSMUST00000047257 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm43621-201ENSMUST00000202733 2022 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Rfxank-201ENSMUST00000075724 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm12126-201ENSMUST00000147717 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Olfr270-202ENSMUST00000172257 939 ntAPPRIS P2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Dlc1-206ENSMUST00000163663 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Cpsf6-208ENSMUST00000177145 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Col28a1-201ENSMUST00000115537 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms