Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Calhm1-201ENSMUST00000111813 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Ucma-202ENSMUST00000115010 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm14427-201ENSMUST00000117183 635 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Myl1-202ENSMUST00000119429 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 n-R5s43-201ENSMUST00000122739 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Snhg17-202ENSMUST00000138592 342 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm11722-201ENSMUST00000138702 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm15756-201ENSMUST00000161447 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm29145-201ENSMUST00000189914 456 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 1700009C05Rik-201ENSMUST00000191101 788 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 1700081B01Rik-202ENSMUST00000197543 648 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm19102-201ENSMUST00000201133 553 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm30781-201ENSMUST00000204743 216 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm18973-201ENSMUST00000205814 511 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm18114-201ENSMUST00000221780 523 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 AC125543.2-201ENSMUST00000222114 105 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 CT030170.7-201ENSMUST00000223372 103 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Tcstv3-202ENSMUST00000223967 779 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 AC156561.1-201ENSMUST00000224774 233 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 AC116596.2-201ENSMUST00000226642 526 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Ucma-201ENSMUST00000027978 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Fabp5l2-201ENSMUST00000072582 408 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Btg1-ps2-201ENSMUST00000089060 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Kctd16-201ENSMUST00000091927 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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TtrP07309 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 AC132384.4-201ENSMUST00000220343 1397 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Magea5-201ENSMUST00000069556 1360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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TtrP07309 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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TtrP07309 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Zfp952-201ENSMUST00000087666 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm28485-201ENSMUST00000185300 1500 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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TtrP07309 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Tmem177-201ENSMUST00000037906 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TtrP07309 Clnk-201ENSMUST00000169819 1700 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TtrP07309 Clnk-202ENSMUST00000171633 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TtrP07309 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TtrP07309 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm6418-201ENSMUST00000118325 3577 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TtrP07309 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TtrP07309 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TtrP07309 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TtrP07309 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TtrP07309 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TtrP07309 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TtrP07309 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TtrP07309 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TtrP07309 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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