Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 1810014B01Rik-205ENSMUST00000218691 323 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Epn2-212ENSMUST00000178202 4317 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
OtofQ9ESF1 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Phactr1-205ENSMUST00000128646 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Grip1-210ENSMUST00000144825 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Net1-202ENSMUST00000099946 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Synj2-208ENSMUST00000115789 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm37069-201ENSMUST00000192742 4142 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Arsj-201ENSMUST00000093976 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Sox6-206ENSMUST00000205405 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm5327-201ENSMUST00000182864 1009 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Ndst2-205ENSMUST00000225000 3661 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Phc3-203ENSMUST00000099163 2808 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Clasp2-202ENSMUST00000163895 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Nup210l-201ENSMUST00000029548 5681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Abce1-201ENSMUST00000080536 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Lpin1-202ENSMUST00000111067 5433 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Phc2-203ENSMUST00000106080 3885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Meis1-209ENSMUST00000185131 3346 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 B020014A21Rik-201ENSMUST00000217333 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 B3galt5-202ENSMUST00000113800 5282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Synj2-209ENSMUST00000115790 4808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Mcf2l-208ENSMUST00000110879 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Pik3cg-207ENSMUST00000220366 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Ptprr-201ENSMUST00000063470 3619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 A930104D05Rik-201ENSMUST00000128601 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm16103-201ENSMUST00000163003 1279 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm6313-202ENSMUST00000150112 2562 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm29311-202ENSMUST00000189721 1532 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Scn3b-201ENSMUST00000049941 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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