Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 AC108846.3-201ENSMUST00000214078 247 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 AC118476.4-201ENSMUST00000215385 790 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Ryk-ps1-201ENSMUST00000219713 235 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gsta2-201ENSMUST00000034902 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Prb1-201ENSMUST00000087853 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 C87977-202ENSMUST00000105754 1407 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Skap1-201ENSMUST00000071510 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm24542-201ENSMUST00000103870 110 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm14682-201ENSMUST00000117977 524 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Sycn-201ENSMUST00000119180 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm11953-201ENSMUST00000122352 1003 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm11464-201ENSMUST00000146963 537 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm15756-201ENSMUST00000161447 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm23403-201ENSMUST00000179169 110 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Trav5d-4-201ENSMUST00000179701 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Trav5n-4-201ENSMUST00000179997 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm27224-201ENSMUST00000184749 564 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 AC153937.2-202ENSMUST00000219583 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm7239-201ENSMUST00000220981 860 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Serpinb6d-202ENSMUST00000221681 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Tctex1d1-208ENSMUST00000223169 683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gkn2-201ENSMUST00000032128 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Slc36a3-202ENSMUST00000069816 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Hdhd2-209ENSMUST00000150990 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Srsf5-203ENSMUST00000110352 1491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Arl15-201ENSMUST00000091201 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm9105-201ENSMUST00000120160 1398 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 AC132384.4-201ENSMUST00000220343 1397 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 AC121942.3-201ENSMUST00000225768 1436 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm1982-201ENSMUST00000188615 1887 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Smok2b-202ENSMUST00000162940 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm12098-201ENSMUST00000118277 508 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Crem-229ENSMUST00000151084 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm23598-201ENSMUST00000157262 144 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms