Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Fer-201ENSMUST00000000129 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Rai14-202ENSMUST00000169385 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gsdmc2-203ENSMUST00000188691 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Golga1-201ENSMUST00000039165 4869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Sypl-202ENSMUST00000076698 4999 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Pnpla1-202ENSMUST00000114737 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Pnpla1-201ENSMUST00000056866 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Bub1b-201ENSMUST00000038341 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gramd4-201ENSMUST00000088931 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Rhpn2-202ENSMUST00000085556 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PtprtQ99M80 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PtprtQ99M80 Npy2r-204ENSMUST00000182831 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Ndp-201ENSMUST00000040134 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PtprtQ99M80 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PtprtQ99M80 Kif18b-201ENSMUST00000021311 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PtprtQ99M80 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PtprtQ99M80 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PtprtQ99M80 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PtprtQ99M80 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Phf19-201ENSMUST00000028232 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Slc13a2os-201ENSMUST00000149865 3627 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Aoah-201ENSMUST00000021757 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gria2-202ENSMUST00000107745 4026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 2310043P16Rik-201ENSMUST00000205403 3881 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Dpp4-201ENSMUST00000047812 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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