Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Acad10-201ENSMUST00000031412 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Arpp21-230ENSMUST00000172380 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Olfr1357-201ENSMUST00000095473 1826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 AI182371-206ENSMUST00000226631 1680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Serpina3f-201ENSMUST00000101080 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Synj2-207ENSMUST00000115788 3498 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm29311-202ENSMUST00000189721 1532 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Dgkg-202ENSMUST00000089925 3555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Arhgap27-201ENSMUST00000041385 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Synj2-209ENSMUST00000115790 4808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm43776-201ENSMUST00000199729 2914 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Arpp19-209ENSMUST00000169492 3963 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Arhgef9-210ENSMUST00000182001 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm16433-201ENSMUST00000062429 1984 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Galk2-201ENSMUST00000028636 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 BC048644-201ENSMUST00000140928 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Nbr1-202ENSMUST00000103098 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Taf1-202ENSMUST00000118878 7210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 D7Ertd443e-201ENSMUST00000094002 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Slc2a5-201ENSMUST00000030826 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm19589-201ENSMUST00000189394 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Kbtbd4-201ENSMUST00000090682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Pcyt1a-201ENSMUST00000079791 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Pnpla1os-201ENSMUST00000146779 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm2163-201ENSMUST00000179734 2723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Rbm25-201ENSMUST00000048155 4226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Cd22-202ENSMUST00000108125 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Psg16-201ENSMUST00000071399 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Exoc1-203ENSMUST00000113493 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Wdr27-206ENSMUST00000228330 2759 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Olfr654-203ENSMUST00000213984 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Adgrl3-218ENSMUST00000122037 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Tktl1-201ENSMUST00000010127 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Bdnf-206ENSMUST00000111046 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Cpne8-202ENSMUST00000064391 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Ccdc116-201ENSMUST00000023452 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Il1rap-201ENSMUST00000023156 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Clcn7-201ENSMUST00000040729 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.7 ms