Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc166S4R181 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms