Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Top3bQ9Z321 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top3bQ9Z321 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms