Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Robo3Q9Z2I4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Robo3Q9Z2I4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms