Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms