Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms