Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tulp1Q9Z273 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tulp1Q9Z273 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms