Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms