Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RfxankQ9Z205 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RfxankQ9Z205 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RfxankQ9Z205 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RfxankQ9Z205 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RfxankQ9Z205 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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RfxankQ9Z205 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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RfxankQ9Z205 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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RfxankQ9Z205 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RfxankQ9Z205 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms