Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ilf3Q9Z1X4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ilf3Q9Z1X4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ilf3Q9Z1X4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ilf3Q9Z1X4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ilf3Q9Z1X4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ilf3Q9Z1X4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ilf3Q9Z1X4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ilf3Q9Z1X4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ilf3Q9Z1X4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms