Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms