Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Syngr4Q9Z1L2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngr4Q9Z1L2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms