Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfkbiaQ9Z1E3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfkbiaQ9Z1E3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfkbiaQ9Z1E3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfkbiaQ9Z1E3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfkbiaQ9Z1E3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfkbiaQ9Z1E3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfkbiaQ9Z1E3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfkbiaQ9Z1E3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfkbiaQ9Z1E3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NfkbiaQ9Z1E3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms