Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1A9

Tbc1d8, TBC1 domain family member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d8Q9Z1A9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d8Q9Z1A9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d8Q9Z1A9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d8Q9Z1A9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tbc1d8Q9Z1A9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbc1d8Q9Z1A9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms