Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl8Q9Z121 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl8Q9Z121 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl8Q9Z121 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl8Q9Z121 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl8Q9Z121 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl8Q9Z121 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl8Q9Z121 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl8Q9Z121 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl8Q9Z121 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl8Q9Z121 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl8Q9Z121 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl8Q9Z121 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms