Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmg20bQ9Z104 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmg20bQ9Z104 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmg20bQ9Z104 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms