Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dctn3Q9Z0Y1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dctn3Q9Z0Y1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms