Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Itgb6Q9Z0T9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb6Q9Z0T9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms