Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L1

S1pr4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1pr4Q9Z0L1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
S1pr4Q9Z0L1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
S1pr4Q9Z0L1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms