Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G0

Gipc1, PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1Q9Z0G0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gipc1Q9Z0G0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gipc1Q9Z0G0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gipc1Q9Z0G0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gipc1Q9Z0G0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gipc1Q9Z0G0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gipc1Q9Z0G0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gipc1Q9Z0G0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gipc1Q9Z0G0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gipc1Q9Z0G0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gipc1Q9Z0G0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gipc1Q9Z0G0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gipc1Q9Z0G0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gipc1Q9Z0G0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gipc1Q9Z0G0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms