Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ap4s1Q9WVL1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms