Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV92

Epb41l3, Band 4.1-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l3Q9WV92 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Epb41l3Q9WV92 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l3Q9WV92 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l3Q9WV92 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l3Q9WV92 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l3Q9WV92 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l3Q9WV92 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l3Q9WV92 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l3Q9WV92 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l3Q9WV92 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l3Q9WV92 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l3Q9WV92 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Epb41l3Q9WV92 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Epb41l3Q9WV92 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l3Q9WV92 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41l3Q9WV92 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms