Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp1a4Q9WV27 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp1a4Q9WV27 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms