Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stub1Q9WUD1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms