Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU12

Snurf, SNRPN upstream reading frame protein, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnurfQ9WU12 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SnurfQ9WU12 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SnurfQ9WU12 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 463.3 ms