Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psmb3Q9R1P1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms