Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed2Q9R0Q3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed2Q9R0Q3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed2Q9R0Q3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed2Q9R0Q3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed2Q9R0Q3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed2Q9R0Q3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed2Q9R0Q3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed2Q9R0Q3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed2Q9R0Q3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed2Q9R0Q3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms