Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
AmfrQ9R049 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AmfrQ9R049 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms