Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh2d3cQ9QZS8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms