Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Clcf1Q9QZM3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Clcf1Q9QZM3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clcf1Q9QZM3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clcf1Q9QZM3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clcf1Q9QZM3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clcf1Q9QZM3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clcf1Q9QZM3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Clcf1Q9QZM3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clcf1Q9QZM3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Clcf1Q9QZM3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clcf1Q9QZM3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms