Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ripk3Q9QZL0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ripk3Q9QZL0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms