Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZK2

Bcar3, Breast cancer anti-estrogen resistance protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcar3Q9QZK2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bcar3Q9QZK2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcar3Q9QZK2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcar3Q9QZK2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcar3Q9QZK2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcar3Q9QZK2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcar3Q9QZK2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcar3Q9QZK2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcar3Q9QZK2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcar3Q9QZK2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms