Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copg1Q9QZE5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copg1Q9QZE5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms