Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps29Q9QZ88 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps29Q9QZ88 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms