Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdh11Q9QYF1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Rdh11Q9QYF1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Rdh11Q9QYF1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Rdh11Q9QYF1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rdh11Q9QYF1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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