Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx4Q9QY61 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms