Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdcQ9QW08 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdcQ9QW08 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms